• facebook
  • Linkedin
  • youtube

Нізкае суадносіны A260/A230 звычайна выклікана прымешкамі з максімальнай даўжынёй хвалі паглынання пры 230 нм.Давайце паглядзім, што ўключаюць гэтыя прымешкі:

  • Агульныя забруджвальнікі

    Даўжыня хвалі паглынання

    Эфект суадносін

    Бялок

    ~230 нм і 280 нм

    Адначасовае скарачэнне А260/A 280і А260/A 280суадносіны

    Гуанидиновая соль

    220-240 нм

    Паменшыць А260/A 280суадносіны

    Фенол

    ~270 нм

    -

    Трызоль

    ~230 нм і 270 нм

    Паменшыць А260/A 280суадносіны

    ЭДТА

    ~230 нм

    Паменшыць А260/A 280суадносіны

    Этанол

    230-240 нм

    Паменшыць А260/A 280суадносіны

 
 
 
Даўжыня хвалі паглынання і значэнне кантраснасці распаўсюджаных забруджвальных рэчываў

Pзабруджванне ратэінам
Забруджванне бялком можна разглядаць як найбольш распаўсюджанае забруджванне ў працэсе экстракцыі нуклеінавых кіслот.Бялок знаходзіцца паміж верхняй воднай фазай і ніжняйарганічныфаза .Забруджванне паменшыць суадносіны A260/A280 і A260/A230 адначасова, і суадносіны A260/A230 зменяцца больш відавочна, чым суадносіны A260/A280.
Падчас наступныхзваротная транскрыпцыяor рэакцыі qPCR, бялковыя рэшткі могуць інгібіраваць або перашкаджаць функцыі ферментаў.Лепшы спосаб пазбегнуць забруджвання бялком - памятаць пра прынцып «хутчэй менш, чым больш, невялікая колькасць шмат разоў» пры аспірацыі супернатанту.

2. Забруджванне гуанідыніем
гідрахларыд (GuHCl) і гуанідзін тиоцианат (GTC) аказваюць эфект дэнатурацыі бялкоў, якія могуць хутка разбураць клеткавыя мембраны падчас працэсу экстракцыі нуклеінавых кіслот, выклікаючы дэнатурацыю бялку і выпадзенне ў асадак.Даўжыня хвалі паглынання GuHCl і GTC складае 220-240 нм, арэшткавая соль гуанідынія паменшыць суадносіны A260/A230.Нягледзячы на ​​​​тое, што рэшткі солі гуанідынія зніжаюць суадносіны,уплыў на далейшыя эксперыменты на самай справе нязначны.

3. Забруджванне тризолом
Асноўным кампанентам Тризола з'яўляецца фенол.Асноўная функцыя фенолу - лізіс клетак і вызваленне бялкоў і рэчываў нуклеінавых кіслот у клетках.Хоць фенол можа эфектыўна дэнатураваць вавёркі, ён не можа цалкам інгібіраваць актыўнасць РНКазы.Такім чынам, 8-гидроксихинолин, гуанидинизотиоцианат, β-меркаптоэтанол і г.д. дадаюць у TRIzol для інгібіравання эндагеннай і экзагеннай РНКазы.
Пры экстракцыі клеткавай РНК Трызол можа хутка лізаваць клеткі і інгібіраваць нуклеазу, якая вылучаецца з клетак, а рэшткавы Трызол значна знізіць суадносіны A260/A230.
Метад апрацоўкі: Пры цэнтрыфугаванні варта адзначыць, што фенол у Тризоле лёгка раствараецца ў воднай фазе пры тэмпературы 4° і пакаёвай тэмпературы.

4. Рэшткі этанолу
Этанол выкарыстоўваецца ў канчатковым працэсе для асаджэння ДНК пры растварэнні іёнаў солі, якія могуць быць звязаны з ДНК.Даўжыня хвалі паглынання самая высокаяпік паглынанняэтанол таксама пры 230-240 нм, якітаксама паменшыць суадносіны A260/A230.
Метад пазбягання рэшткаў этанолу можна паўтарыць двойчы падчас канчатковага элюіравання, удзімаючывыцяжная шафана працягу двух хвілін, каб этанол цалкам выпарыўся перад даданнем буфера для элюирования.
Аднак варта ведаць, што каэфіцыент - гэта толькі ацэначны паказчык якасці РНК.Калі вышэйзгаданыя аперацыі строга рэгулююцца, адхіленне паміж суадносінамі і стандартным дыяпазонам не будзе мець вялікага ўплыву на далейшыя эксперыменты.
Спадарожныя тавары:
Набор для вылучэння агульнай РНК жывёл
Набор для вылучэння агульнай РНК раслін
Набор для вылучэння агульнай РНК клетак
Набор для вылучэння агульнай РНК раслін Plus


Час публікацыі: 10 лютага 2023 г